Le origini del motociclismo sammarinese risalgono ai lontani anni trenta. Il primo pilota professionista fu Marino Bombini che nel 1938 vinse la prestigiosa  24 Ore del Bol D’Or.  Nove anni dopo, nell’ immediato dopoguerra, si svolse la prima gara di moto a San Marino  Il Giro dei Castelli che riscosse grande successo in un periodo di forte crisi.  Nel 1961 si corse la seconda gara: la Gran Coppa Libertas con partenza fa Borgo Maggiore. Seguirono altre competizioni e nacque la Federazione Automotoristica Sammarinese che accomunava auto e moto. Nel 1965 la FAMS si scorpora e fine fondata ufficialmente la

Federazione Sammarinese Motociclistica.
Nei primi anni ’90 cerca di farsi strada nel motociclismo agonistico il sammarinese Claudio Tonnini che 1993 debutta come wild card nel Mondiale 250 in occasione del Gran Premio di San Marino al Mugello. Nello stesso periodo la FSM aderisce con entusiasmo alla nascita del Mondiale SBK ed organizza fin da subito una gara iridata sul circuito di Misano mentre il Gran Premio di San Marino continua ad essere inserito regolarmente nel calendario del Mondiale Velocità. Dopo Imola, Misano e Mugello, torna in riva al Santerno e nell’ottobre 1998 debutta come wild card un ragazzino sammarinese: Manuel Poggiali. L’anno dopo, sempre a Imola, esordiscono i fratelli Alex e William De Angelis.Nel 2000 Poggiali sale per la prima volta sul podio nel Mondiale 125 classificandosi terzo ad Assen e l’anno dopo si laurea Campione del Mondo su Gilera al termine di una stagione straordinaria. L’anno successivo lotta per il titolo ma non riesce a ripetersi e si classifica al secondo posto.
Nel 2003 debutta in 250 e si laurea subito Campione del Mondo su Aprilia battendo Elias, Rolfo e Pedrosa. Nel motomondiale si fa valere anche Alex De Angelis che dopo aver vinto il premio quale miglior esordiente nel Mondiale 125, nel 2006 diventa vice-campione del mondo classe 250.
Nel 2007 San Marino torna ad avere una gara del Mondiale velocità: il Gran Premio di San Marino e della Riviera di Rimini, andato in scena il 2 settembre sul circuito di Misano.Nel Mondiale 250 del 2007 Alex De Angelis ha conquistato uno splendido terzo posto finale.
De Angelis approda poi alla MotoGP ed attualmente è tra i principali protagonisti del Mondiale Moto2. Nel 2010 Alex Zanotti partecipa alla Dakar: è il primo pilota della F.S.M. al via del rally più prestigioso.

Il primo Presidente è Italo Amati. L’anno dopo la FSM si affilia alla Federazione Motociclistica Internazionale. Nel 1968 viene inaugurato il Crossodromo della Baldasserona che nel 1973 ospita la prima gara del Mondiale di Motocross Sesto Trofeo FIM riservato alla classe 125.

Nel 1974 la FSM organizza il Congresso della Federazione Internazionale Motociclistica conquistando fin dalle origini un importante ruolo a livello mondiale. Nello stesso anno viene organizzato anche il Rally Motociclistico Internazionale Repubblica di San Marino – Città di Rimini. L’organizzazione è perfetta e il pubblico numerosissimo.

Nel 1978 la FSM debutta come promoter di una gara del Mondiale Velocità organizzando a Misano il Gran Prix classe 250 e 350. Nel 1981 va in scena il Primo Gran Premio di San Marino all’autodromo di Imola.

Italo Amati è il Presidente della FSM fino al 1984 quando gli succede Italo Zani che, dopo essere stato vice-presidente fin dalle origini – ricopre la massima carica per un quadriennio.Nell’ 89 viene eletto alla presidenza Amedeo Michelotti, destinato a diventare una figura storica della FSM guidandola per molte generazioni. Michelotti è tutt'ora il presidente federale ed in tutti questi anni ha mantenuto l'entusiasmo degli esordi.